Le fonctionnement de la fontaine d'Héron est basé sur la pression hydraulique.
Le jet d'eau est obtenu par la compression successive de l'eau et de l'air. C'est la pression hydraulique.
Au fur et à mesure que l'eau du bac C arrive au ballon A ,l'eau prend la place de l'air. L'air sort du ballon A pour aller dans le ballon B en raison de la pression exercée par l'eau, l'air du ballon B prend à son tour la place de l'eau celle-ci qui est obligée de passer par le tuyau pour arriver jusqu'au bac C pour qu'elle puisse enfin jaillir.
